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Paolo Cremaschi




sostiene il posto di dottorato del dott. Cremaschi

 

IGM-CNR, Via Abbiategrasso, 207 - 27100 Pavia, Italy

tel: +39-0382-546362
fax: +39-0382-422286
E-mail: cremaschiigm.cnr.it
http://www.igm.cnr.it

 

 

Curriculum Vitae

 

RS Ricerca e Sviluppo, sistemista e sviluppatore (1996)

 

I.T.I. Information Technology Italia, sviluppatore senior (2000)

 

ZeroUno informatica, consulente informatico (2001)

 

everis, consulente informatico (2010)

 

everis, consulente senior e quadro della divisione industria (2011)

 

Laurea in Scienze Biologiche presso l'Università di Pavia (2012)

 

Assegno di ricerca presso l'Istituto di Genetica Molecolare del CNR (2012)

 

Dottorando di ricerca in Genetica, Biologia Molecolare e Cellulare, Università di Pavia (dal 2012)

 

 

 

 

Attività di ricerca

 

Svolgo l’attività di ricerca per il dottorato di ricerca nel laboratorio di biologia computazionale dell’Istituto di Genetica Molecolare IGM – CNR sotto la supervisione della Dott.ssa Silvia Bione. 

La mia attività di ricerca è rivolta all’integrazione di dati derivanti da diverse tipologie di “omics technologies” oggi disponibili. In particolare mi occupo dell’analisi dei risultati di esperimenti "high-throughtput" nel campo della trascrittomica attraverso lo sviluppo di algoritmi di “machine learning” e di “data mining”.

Attualmente la mia attività riguarda lo sviluppo di uno strumento bioinformatico per l’analisi della co-espressione di geni mirato all’identificazione di pathway funzionali.

 

Lo sviluppo di tale strumento include:

  • lo sviluppo di un processo di ETL (Extract Transform and Load)
  • sviluppo di una banca dati strutturata
  • creazione e ottimizzazione di un algoritmo per l’analisi dei dati
  • sviluppo di una interfaccia Web per l’accesso pubblico allo strumento
  • ottimizzazione dell’elaborazione tramite la parallelizzazione dei processi

 

 

 

 

 

Come parte di questo progetto sto collaborando con l’Istituto di Matematica Applicata e Tecnologie Informatiche IMATI - CNR al fine implementare l’algoritmo per l’analisi della co-espressione in linguaggi che permettano di sfruttare pienamente architetture per il calcolo parallelo (Fortran e C++).

 

Comunicazioni a Congressi

Cremaschi P, Rovida S, Sacchi L, Lisa A, Montecucco A, Biamonti G, Bione S, Sacchi G – 2012 Inside complex disorder pathways through gene expression analysis (oral comunication)

ATTI Convegno Intelligence Data Analysis in Biomedicine and Pharmacology IDAMAP Pavia (PV) in stampa

 

Cremaschi P, Rovida S, Sacchi L, Lisa A, Montecucco A, Biamonti G, Bione S, Sacchi G – 2012 CorrelaGenes: a new tool for the interpretation of the human transcriptome (poster)

ATTI Convegno NETTAB Como (CO) in stampa

 

R. Rossi, E. Savini, P. Cremaschi, F. Weighardt, G. Biamonti, G. Ciarrocchi e A. Montecucco - 1995 Dissezione funzionale della DNA ligasi I di mammifero: identificazione dei segnali coinvolti nella localizzazione nucleare e subnucleare della proteina (oral comunication)

ATTI Convegno Congiunto ABCD-AGI-SIBBM-SIMGBM, Montesilvano Lido (PE), 5.25, pag.

 

 


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